El Sistema de Gestión de Control Interno fue conceptualizado y diseñado con el propósito de agilizar la elaboración de los programas de trabajo (PTAR y PTCI) y los reportes de avance, además de mantener actualizada la matriz de riesgos institucional.

Se trata de una herramienta informática desarrollada al interior del INE provista de diversas pantallas en las que las Unidades Responsables capturan la información relativa a un programa de trabajo o un reporte de avance y en línea los responsables, tanto de la Unidad Responsable como personal de Control Interno, revisan, validan y aprueban hasta obtener los documentos formalizados.

El sistema está disponible a partir de 2023 y la principal ventaja es que permite elaborar PTAR, PTCI y sus reportes de avance en diferentes Unidades Responsables al mismo tiempo, sin necesidad de organizar reuniones de trabajo, ya que las personas que intervienen reciben notificaciones y realizan las actividades secuencialmente.